离子对试剂是由强亲水离子形成，反作用于样品分子中的中性离心子对。

因此，可用于同时分离带电分子和非带电分子。

一般适用所有色谱固定相，流动相含水至少达10％，否则就有产生沉淀的危险（特别是在使用乙腈的情况下）。

当使用长链的离子对试剂时，如十六烷基硫酸铵或十二烷基硫酸钠，色谱柱将选用反相色谱柱。

离子对试剂的适用浓度:短链离子对试剂：5×10-3 mol/L长链离子对试剂：5×10-4 mol/L。