两者的区别如下：一、定义不同系统软件是指控制和协调计算机及外部设备,支持应用软件开发和运行的系统，是无需用户干预的各种程序的集合，主要功能是调度，监控和维护计算机系统；负责管理计算机系统中各种独立的硬件，使得它们可以协调工作。

2、应用软件是为满足用户不同领域、不同问题的应用需求而提供的那部分软件，可以拓宽计算机系统的应用领域，放大硬件的功能。

二、运行环境不同操作系统可以直接安装到相应的硬件设备上，比如常见Windows系统就直接安装在电脑中。

2、应用软件不能直接安装在无操作系统的电脑中。

三、对硬件的控制权限不同操作系统直接控制电脑或者电子设备的硬件，管控所载设备一切硬件操作。

2、应用软件，不能直接控制所在平台硬件。

参考资料来源：百度百科-应用程序参考资料来源：百度百科-操作系统。